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动植物基因组目的区域富集测序是一种针对特定目标区域的高通量测序技术,主要应用于动植物基因组中目的区域的富集和深度测序。该技术可以通过捕获靶向DNA序列来提高覆盖度和深度,从而实现对基因组特定区域的深入分析,包括基因结构、单核苷酸多态性等。
样本类型:溶解于蒸馏水或TE (pH 8.0)中的基因组DNA
样品需求量:浓度≥20 ng/μL,总量≥1 μg(可检测70个片段)
样品完整度:琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA完整性,要求电泳条带清晰可见,无明显降解,且无RNA污染
样品运输:DNA低温运输,每个离心管用parafilm膜密封
通常包括以下步骤:
1)DNA提取:从样品中提取高质量的基因组DNA。
2)建立文库:将DNA样品分成小片段并连接到测序文库中,通常包括断裂、修复、末端连接、寡核苷酸齐聚和连接等步骤。
3)富集目的区域:使用特定探针或引物将特定目标区域捕获或扩增。
4)测序:对富集的目标区域进行高通量测序。
5)分析:对测序数据进行分析和注释,以识别和分析特定目标区域的变异。
1、什么是目的区域富集测序?
答: 目的区域富集测序是一种高通量测序技术,其主要用途是针对基因组中特定区域进行深度测序,以探究这些区域的遗传变异、突变和表达情况等。该技术通常包括两个步骤:富集目的区域(例如外显子区域)和高通量测序。
2、目的区域富集测序与全基因组测序有何不同?
答: 目的区域富集测序与全基因组测序相比,可以针对特定区域进行深度测序,从而提高检测特定变异的灵敏度和准确性。此外,与全基因组测序相比,目的区域富集测序可以大大降低测序成本和数据分析难度,特别是在大规模研究应用中具有较高的实用性和效率。
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