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SNPscan®高通量SNP分型
  • SNPscan®高通量SNP分型技术是由上海天昊生物科技有限公司自主专利开发的多重SNP分型专利技术,能在一个检测流程中同时实现对48/96/144/192个SNP位点进行分型。该技术基本原理是采用连接酶连接反应的高特异性实现对SNP位点等位基因的识别,然后通过在连接探针末段引入不同长度的非特异序列以及通过连接酶加接反应获得位点对应的不同长度连接产物,利用标记荧光的通用引物对连接产物进行PCR扩增,通过荧光毛细管电泳对扩增产物进行电泳分离,后通过对GeneMapper软件分析获取各个SNP位点的基因型。

    该技术适合于针对中等通量到大通量SNP位点的分型项目,至少800个以上样本、48个以上的SNP位点;对绝大多数SNP位点都具有很好的分型效果。整个技术的示意图如下:

    技术路线:

    image.png




  • 样品需求量:基因组DNA满足20-50 ng/μL,总量≥ 200 ng(1个反应)

    样本纯度:无色透明,OD260/280 = 1.8~2.0;OD260/230≥ 2.0

    样品完整度:琼脂糖电泳检测要求主条带清晰,无明显弥撒及拖尾,无RNA及蛋白污染

    样品保存和运输要求:-20°C保存,冰袋运输




  • image.png

    图 SNPscan®多重荧光图谱




  • SNPscan®部分客户文章:

    英文标题

    中文标题

    杂志

    年份

    Interaction of fluoride exposure and CREB1 gene polymorphisms on thyroid function in school-age children

    氟暴露与CREB1基因多态性对学龄儿童甲状腺功能的相互作用

    Chemosphere

    2022

    Analysis of the association of ANO3/MUC15, COL4A4, RRBP1, and KLK1 polymorphisms with COPD susceptibility in the Kashi population

    分析ANO3/MUC15、COL4A4、RRBP1和KLK1多态性与喀什人群COPD易感性的关系

    BMC Pulmonary Medicine

    2022

    Interaction analysis of gene variants of TCF7L2 and body mass index and waist circumference on type 2 diabetes

    TCF7L2基因变异与2型糖尿病患者体重指数和腰围的相互作用分析

    Clinical Nutrition

    2021

    Methylation quantitative trait locus rs5326 is associated with susceptibility and effective dosage of methadone maintenance treatment for heroin use disorder

    甲基化数量性状位点rs5326与美沙酮维持治疗海洛因使用障碍的易感性和有效剂量相关

    Psychopharmacology

    2021

    Genetics and Functional Mechanisms of STAT3 Polymorphisms in Human Tuberculosis

    人结核中STAT3多态性的遗传和功能机制

    Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

    2021

    Genetic predisposition to impaired metabolism of the branched chain amino acids, dietary intakes, and risk of type 2 diabetes

    支链氨基酸代谢受损、饮食摄入和2型糖尿病风险的遗传易感性

    Genes and Nutrition

    2021

    Human X chromosome exome sequencing identifies BCORL1 as contributor to spermatogenesis

    人类X染色体外显子组测序确定BCORL1是精子发生的贡献者

    Journal of Medical Genetics

    2021

    Association of MicroRNA Biogenesis Genes Polymorphisms with Risk of Large Artery Atherosclerosis Stroke

    miRNA生物发生基因多态性与大动脉粥样硬化卒中风险的关系

    Cellular and Molecular Neurobiology

    2021




  • 1.SNPscan一般能检测多少个位点?

    答:SNPscan技术比较适合40-200个位点的SNP分型。




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