昊为泰生物多年专注于深耕遗传学和基因组学等领域科研特色技术的开发,不断跟进国际先进的科研成果及技术发展,创新研发了许多特色专利技术和领域内前沿的检测服务项目,受到广大专业科研用户的认可和好评。
SSR简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR),也称微卫星(Microsatellite)或短串联重复序列(Short Temdem Repeats,STR),其串联重复的核心序列常为1-6 bp,是一种广泛分布在真核生物基因组中的重复序列。由于其自身具有共显性遗传,多态位点多,信息含量丰富,物种间转移性好,易于检测,重复性好的特点,因此广泛应用于动植物遗传多样性、亲缘关系分析、品种鉴定、分子标记辅助选择、QTL定位等研究。
天昊生物依托自身技术优势,开发出了基于Illumina二代测序平台的SSRseq®超高通量SSR分型技术。该技术针对目的区域SSR设计多重PCR扩增体系,一个扩增反应体系可以完成15个SSR标记的PCR反应,然后对目的片段进行二代测序。此技术可以直接检测到同一SSR位点不同等位基因的序列信息,不但能达到单碱基分辨率,并且能够准确给出每个等位基因SSR重复单元的具体重复次数和不同等位基因的相对比例,不需要人工判读基因型,基于生物信息学分析流程高效、准确分型,适用于二倍体物种,尤其适合异源多倍体物种SSR位点检测。您只需提供样品DNA及SSR位点信息,我们便可帮您完成从实验检测到数据分析整体服务。
如果您对我们的SSRseq®技术感兴趣,那就抓紧时间约起来吧。
讲座内容概要
1、SSR简介
2、传统SSR检测方法及不足
3、SSRseq®技术特点及优势
4、SSRseq成功案例 -- 六倍体油茶SSR检测
部分客户文章
1.High-throughput sequencing-based microsatellite genotyping for polyploids to resolve allele dosage uncertainty and improve analyses of genetic diversity, structure and differentiation: A case study of the hexaploid Camellia oleifera, Mol Ecol Resour., 2022
2. SSR-Sequencing Reveals the Inter- and Intraspecific Genetic Variation and Phylogenetic Relationships among an Extensive Collection of Radish (Raphanus) Germplasm Resources, Biology (Basel)., 2021
部分课件内容
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