昊为泰生物多年专注于深耕遗传学和基因组学等领域科研特色技术的开发,不断跟进国际先进的科研成果及技术发展,创新研发了许多特色专利技术和领域内前沿的检测服务项目,受到广大专业科研用户的认可和好评。
由中国土壤学会土壤生物和生化专业委员会主办,中国科学院东北地理与农业生态研究所和东北师范大学地理科学学院共同承办的“中国土壤学会土壤生物和生化专业委员会暨土壤健康培育与可持续利用研讨会”,于2024年6月16-18日在吉林长春顺利召开。
本次会议围绕我国的土壤健康培育和农业可持续性等关键问题展开,通过几十场大会报告,系统总结了近年来在该领域取得的重要进展,增进了学者间的深入交流。
大会由中国科学院南京土壤研究所褚海燕研究员主持,主办方领导先后致辞。
褚海燕研究员主持大会开幕式
中国科学院东北地理与农业生态研究所姜明所长致欢迎辞
东北师范大学魏民副校长致欢迎辞
之后,大会特别邀请朱永官院士做了《One Health视角下的抗生素耐药性》大会报告。
(以上照片来源官方图片直播平台)
上海天昊生物科技有限公司作为企业代表参展了本次会议,除了展示近年来我们在扩增子绝对定量测序方面取得的成绩外,还首次带来了全新研发的宏基因组绝对定量测序专利技术。该技术尤其适合土壤微生物相关功能基因的绝对定量分析,一次检测能够同时获得碳、氮、磷、硫循环,以及抗生素等相关功能基因的相对定量和绝对定量结果,数据更加全面,结果更加真实,能更好反映样本中微生物的基因功能,我们的技术也得到了与会老师们的积极关注和认可。
天昊生物展台现场
在这里我们由衷感谢各位老师对我们技术服务的认可和支持,天昊生物将继续以"创新基因科技,成就科学梦想"作为公司发展核心理念,为助力我国微生物学的发展提供优质的服务。欢迎联系我们具体咨询!
属于微生物组“绝对定量”的时代,已经到来!
01 天昊生物Accu16S®细菌与AccuITSTM真菌绝对定量测序专利技术简介:
天昊生物开发的微生物Accu16S®细菌与AccuITSTM真菌绝对定量测序技术,是一种基于添加内标序列的微生物绝对定量检测方法。本技术通过向样品DNA中添加天昊专利的人工合成已知拷贝数内标序列,然后进行16S扩增子文库构建、测序,再根据内标序列reads数及其绝对拷贝数绘制出标准曲线,后可获得样品中OTU代表序列对应的细菌物种绝对拷贝数。利用该方法,研究者可以同时获得绝对定量分析结果、常规扩增子相对定量结果,以及相对定量与绝对定量的比较分析结果,可谓“一次检测,三套结果”,数据更加全面准确。
02 传统的微生物扩增子相对定量测序的“技术痛点”:
1、只能获得相对定量结果,可能推导出错误结论;
2、传统qPCR等方法定量费时费力,无法避免跨平台系统误差;
3、针对特殊样本,无法排除PCR抑制剂干扰。
上图为微生物群“相对丰度(Relative abundance)”和“绝对丰度(Absolute abundance)”随时间变化比较示意图。只检测相对定量数据会掩盖了潜在微生物群落的动态变化,使变化过程中的差异更难被发现。(图片来源:Nature,2021)
上图为菌群组装过程主要由微生物之间不对称的相互作用,而基于相对丰度的数据推断出的相互作用会产生误导性的错误结果。a,相对丰度数据无法正确推断互作网络中的不对称相互作用,例如相对丰度无法检测到Staphylococcus 对Klebsiella生长的促进,还错误地推断Staphylococcus 对Candida的促进,并且无法检测到Candida或Enterococcus对Klebsiella 的生长抑制。而绝对丰度则准确推断出了上述互作关系,并且利用动物实验得以确认。(图片来源:Nature,2021)
上图为人类肠道菌群变化与微生物定量方法之间存在差异。本研究发现克罗恩氏病患者(CD)和对照人群(Control)粪便微生物的“相对丰度(RMP)”和“绝对丰度(QMP)”结果,在一些菌属中存在显著性差异。只考虑“相对定量”结果,可能会造成结论的错误或者关键菌属信息的丢失。(图片来源:Nature,2017)
03 天昊扩增子绝对定量测序技术优势:
一次检测,三套数据,结果更丰富;
对样本的需求量要求低,避免因样本无备份等造成的无法检测情况;
检测通量高,检测合格范围内各类菌种均可绝对定量;
相对定量和绝对定量数据相互印证,减少传统相对定量假阳性问题;
避免跨平台qPCR定量的系统误差;
内标法比qPCR在定量上具有更高的特异性、灵敏度和更好的一致性;
避免因样本DNA抽提等原因造成的PCR抑制剂残留对结果准确性的影响;
避免qPCR等定量实验碰到的引物设计和优化难题。
取得成绩
截至目前,天昊客户利用微生物绝对定量测序共发表SCI文章59篇,其中JCR分区在Q1区的高分文章多达29篇,研究领域涉及医学、环境、食品、农学和生态等各个领域,样本类型包括人类及动物粪便、土壤、体外发酵液、水体生物膜、酒类发酵物及口拭子DNA样本等。
天昊客户文章中关于“绝对定量”和“相对定量”异同结果的描述:
关于天昊
上海天昊生物科技有限公司,2008年4月创建于上海浦东张江高科技园区,上海市高新技术企业。天昊生物建立了整套完备的实验室管理体系和标准流程,为国内外基因生物领域科研机构、医学院校以及生物制药企业提供精确、高效的基因检测分析服务。
天昊生物具有极强的技术研发实力,研发了多项具有国际水平的专利技术,包括多种SNP分型和拷贝数检测技术、微生物16S扩增子绝对定量技术。同时利用专利自主研发的AccuCopy®、CNVplex®、SNPscan®、iMLDR®、EasyTarget®、FastTarget®、SNPseq®、CNVseq®、MethylTarget®和SSRseq®等全新技术为客户提供灵活定制科研项目检测服务。在2018年荣获“浦东新区企业研发机构”称号,2023年荣获“上海市专精特新中小企业”称号。
天昊生物遗传分析中心借助多名长期从事基因及遗传分析的领域专家构成的专家咨询团队,专业团队结合准确、高效、经济的科研技术服务体系,致力于长期为分子生物学及医学遗传学领域的研究者提供高质量的科研策略咨询、实验技术服务和遗传数据分析,帮助广大科研人员获得更为优质的科研成果。
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