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会议预告 | 天昊将携全新宏基因组绝对定量技术服务参展【中国土壤学会土壤生物和生化专业委员会暨土壤健康培育与可持续利用研讨会】
发布时间:2024-06-14

土壤健康是土壤持续保持陆地生态系统生产力、生物多样性和环境服务功能的能力,而健康土壤培育是农业可持续性的关键实践。通过提高土壤肥力和植物产能来提升土壤生产力,通过提高和维持土壤生物多样性来维持生物功能,通过优化环境服务功能来维持土壤可持续发展,是健康土壤培育要解决的关键问题和终目标。

为了增进学术交流,加强多学科交叉融合,由中国土壤学会土壤生物和生化专业委员会主办,中国科学院东北地理与农业生态研究所和东北师范大学地理科学学院共同承办的“中国土壤学会土壤生物和生化专业委员会暨土壤健康培育与可持续利用研讨会”,将于2024年6月16-18日在吉林长春举行。


会议介绍


中国土壤学会土壤生物和生化专业委员会暨土壤健康培育与可持续利用研讨会:

会议时间:6月16日-6月18日

举办地点:长春华天大酒店六楼会展厅

天昊展台:3号展台

会议日程

6月16日报到注册(9:00—22:00)

6月17日全天学术报告

6月18日上午学术报告

6月18日下午生物信息培训


特邀报告

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天昊生物参展

天昊生物将参展本次大会,除了继续推广天昊生物Accu16S®细菌和AccuITSTM真菌绝对定量测序专利技术外,我们还带来了全新推出的重磅技术—AccuMetaTM宏基因组绝对定量测序专利技术。该技术特别适合针对土壤微生物相关碳、氮、磷、硫循环及其他功能基因进行绝对定量检测,分析内容更全面,提供的数据更丰富。该专利技术将为我国土壤健康培育与可持续利用研究,提供更加专业、更高质量的“天昊绝对定量特色解决方案”。


欢迎各位老师莅临上海天昊生物3号展位交流咨询!

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会议日程

请参见会议链接:(可点击下方阅读原文)http://www.csss.org.cn/info7/1055.html


属于微生物组“绝对定量”的时代,已经到来!


01 天昊生物Accu16S®细菌与AccuITSTM真菌绝对定量测序专利技术简介:

天昊生物开发的微生物Accu16S®细菌与AccuITSTM真菌绝对定量测序技术,是一种基于添加内标序列的微生物绝对定量检测方法。本技术通过向样品DNA中添加天昊专利的人工合成已知拷贝数内标序列,然后进行16S扩增子文库构建、测序,再根据内标序列reads数及其绝对拷贝数绘制出标准曲线,后可获得样品中OTU代表序列对应的细菌物种绝对拷贝数。利用该方法,研究者可以同时获得绝对定量分析结果、常规扩增子相对定量结果,以及相对定量与绝对定量的比较分析结果,可谓“一次检测,三套结果”,数据更加全面准确

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02 传统的微生物扩增子相对定量测序的“技术痛点”:

1、只能获得相对定量结果,可能推导出错误结论;

2、传统qPCR等方法定量费时费力,无法避免跨平台系统误差;

3、针对特殊样本,无法排除PCR抑制剂干扰。

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上图为微生物群“相对丰度(Relative abundance)”和“绝对丰度(Absolute abundance)”随时间变化比较示意图。只检测相对定量数据会掩盖了潜在微生物群落的动态变化,使变化过程中的差异更难被发现。(图片来源:Nature,2021)


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上图为菌群组装过程主要由微生物之间不对称的相互作用,而基于相对丰度的数据推断出的相互作用会产生误导性的错误结果。a,相对丰度数据无法正确推断互作网络中的不对称相互作用,例如相对丰度无法检测到Staphylococcus 对Klebsiella生长的促进,还错误地推断Staphylococcus 对Candida的促进,并且无法检测到Candida或Enterococcus对Klebsiella 的生长抑制。而绝对丰度则准确推断出了上述互作关系,并且利用动物实验得以确认。(图片来源:Nature,2021)


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上图为人类肠道菌群变化与微生物定量方法之间存在差异。本研究发现克罗恩氏病患者(CD)和对照人群(Control)粪便微生物的“相对丰度(RMP)”和“绝对丰度(QMP)”结果,在一些菌属中存在显著性差异。只考虑“相对定量”结果,可能会造成结论的错误或者关键菌属信息的丢失。(图片来源:Nature,2017)


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03 天昊扩增子绝对定量测序技术优势:

一次检测,三套数据,结果更丰富;

对样本的需求量要求低,避免因样本无备份等造成的无法检测情况;

检测通量高,检测合格范围内各类菌种均可绝对定量;

相对定量和绝对定量数据相互印证,减少传统相对定量假阳性问题;

避免跨平台qPCR定量的系统误差;

内标法比qPCR在定量上具有更高的特异性、灵敏度和更好的一致性;

避免因样本DNA抽提等原因造成的PCR抑制剂残留对结果准确性的影响;

避免qPCR等定量实验碰到的引物设计和优化难题。

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取得成绩

截至目前,天昊客户利用微生物绝对定量测序共发表SCI文章59篇,其中JCR分区在Q1区的高分文章多达29篇,研究领域涉及医学、环境、食品、农学和生态等各个领域,样本类型包括人类及动物粪便、土壤、体外发酵液、水体生物膜、酒类发酵物及口拭子DNA样本等。

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天昊客户文章中关于“绝对定量”和“相对定量”异同结果的描述:

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关于天昊


上海天昊生物科技有限公司,2008年4月创建于上海浦东张江高科技园区,上海市高新技术企业。天昊生物建立了整套完备的实验室管理体系和标准流程,为国内外基因生物领域科研机构、医学院校以及生物制药企业提供精确、高效的基因检测分析服务。

天昊生物具有极强的技术研发实力,研发了多项具有国际水平的专利技术,包括多种SNP分型和拷贝数检测技术、微生物16S扩增子绝对定量技术。同时利用专利自主研发的AccuCopy®、CNVplex®、SNPscan®、iMLDR®、EasyTarget®、FastTarget®、SNPseq®、CNVseq®、MethylTarget®和SSRseq®等全新技术为客户提供灵活定制科研项目检测服务。在2018年荣获“浦东新区企业研发机构”称号,2023年荣获“上海市专精特新中小企业”称号。

天昊生物遗传分析中心借助多名长期从事基因及遗传分析的领域专家构成的专家咨询团队,专业团队结合准确、高效、经济的科研技术服务体系,致力于长期为分子生物学及医学遗传学领域的研究者提供高质量的科研策略咨询、实验技术服务和遗传数据分析,帮助广大科研人员获得更为优质的科研成果。






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