昊为泰生物多年专注于深耕遗传学和基因组学等领域科研特色技术的开发,不断跟进国际先进的科研成果及技术发展,创新研发了许多特色专利技术和领域内前沿的检测服务项目,受到广大专业科研用户的认可和好评。
Twist NGS甲基化检测系统提供了一个强大的端到端样品制备解决方案,用于鉴定人类基因组中的甲基化区域。文库制备采用NEBNext® EM-seq酶反应转化,能够显著降低对DNA的损伤,可以更大限度地保留DNA的片段化模式,而且需要较少的样品起始量,从而产生更高质量、更好性能的文库。随后,Twist甲基化panel设计为CpG检测的目标富集提供了非常有效的探针。其中人甲基化组的探针可以覆盖123Mb的靶向区域,涵盖了人类基因组中的398万个CpG位点。
技术路线:
技术优势:
•对样本起始量要求更低,适用于cfDNA样本;
•酶反应处理可以降低DNA损耗,实现更高质量文库;
•相对于935K芯片,可以实现更大的目标区域捕获;
•可以灵活定制,满足客户对于不同panel检测需求。
样本类型:完整无污染的基因组DNA
样本浓度:浓度≥ 20 ng/μL
样本纯度:OD260/280介于1.8-2.0,OD260/230 ≥ 2.0
样本需求量:总量≥ 1 μg
数据分析内容:
1) 原始测序数据质控 2) 参考基因组比对 3) 原始甲基化位点信息 4) 整体甲基化差异分析 5) 甲基化差异位点分析 6) 甲基化差异区域分析 7) GO和KEGG富集分析 |
1.利用Enzymatic Methyl-seq酶法转化胞嘧啶的效率如何?
答:利用酶法转化未修饰的胞嘧啶,其转化效率能达到99.7%左右,同时能够很好地保护DNA样本防止被降解。
2.Twist人甲基化panel除了现有的123Mb的,能够根据我的目标基因实现定制吗?
答:可以的,Twist除了固定的大panel外,能够满足客户的个性化需求实现panel定制,而且已经在多个项目中被应用,包括GRAIL公司定制靶向panel用于肿瘤的早期诊断。
3.如何看待Twist甲基化捕获测序和Illumina甲基化芯片的关系?
答:这两项技术可以实现比较好的互补,Illumina的芯片是固定的panel,但是应用的比较早而且很广泛,而Twist方法可以实现灵活设计,扩大研究的目标区域,同时满足个性化的需求。
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