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TWIST甲基化捕获测序
  • Twist NGS甲基化检测系统提供了一个强大的端到端样品制备解决方案,用于鉴定人类基因组中的甲基化区域。文库制备采用NEBNext® EM-seq酶反应转化,能够显著降低对DNA的损伤,可以更大限度地保留DNA的片段化模式,而且需要较少的样品起始量,从而产生更高质量、更好性能的文库。随后,Twist甲基化panel设计为CpG检测的目标富集提供了非常有效的探针。其中人甲基化组的探针可以覆盖123Mb的靶向区域,涵盖了人类基因组中的398万个CpG位点。

    技术路线:

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    技术优势:

    对样本起始量要求更低,适用于cfDNA样本;

    酶反应处理可以降低DNA损耗,实现更高质量文库;

    相对于935K芯片,可以实现更大的目标区域捕获;

    可以灵活定制,满足客户对于不同panel检测需求。




  • 样本类型:完整无污染的基因组DNA

    样本浓度:浓度≥ 20 ng/μL

    样本纯度:OD260/280介于1.8-2.0,OD260/230 ≥ 2.0

    样本需求量:总量≥ 1 μg








  • 数据分析内容:

    1) 原始测序数据质控

    2) 参考基因组比对

    3) 原始甲基化位点信息

    4) 整体甲基化差异分析

    5) 甲基化差异位点分析

    6) 甲基化差异区域分析

    7) GO和KEGG富集分析


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  • 1.利用Enzymatic Methyl-seq酶法转化胞嘧啶的效率如何?

    答:利用酶法转化未修饰的胞嘧啶,其转化效率能达到99.7%左右,同时能够很好地保护DNA样本防止被降解。


    2.Twist人甲基化panel除了现有的123Mb的,能够根据我的目标基因实现定制吗?

    答:可以的,Twist除了固定的大panel外,能够满足客户的个性化需求实现panel定制,而且已经在多个项目中被应用,包括GRAIL公司定制靶向panel用于肿瘤的早期诊断。


    3.如何看待Twist甲基化捕获测序和Illumina甲基化芯片的关系?

    答:这两项技术可以实现比较好的互补,Illumina的芯片是固定的panel,但是应用的比较早而且很广泛,而Twist方法可以实现灵活设计,扩大研究的目标区域,同时满足个性化的需求。





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