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非靶向代谢组学检测
  • 非靶向代谢组学检测(untargeted metabolomics)是一种系统性的代谢产物检测方法,可以检测样品中所有存在的代谢产物,包括已知和未知的化合物。该技术一般采用液相色谱质谱联用技术(LC-MS/MS)进行分析,通过将样品中的代谢产物进行分离和定量,进而获取代谢物组的全貌信息。这种方法可以在不需要事先确定代谢产物的情况下,对样品中的所有代谢物进行检测和鉴定,因此具有很高的发现性和全面性。





  • (1)样品类型:可以是生物样品,如血液、尿液、脑脊液等;也可以是食品、土壤等环境样品。

    (2)样品处理:样品要求完整,未被污染或降解。对于生物样品,需要快速处理,以避免样品中代谢物在采样过程中发生变化。对于不同样品类型,可以采用不同的处理方法。

    (3)样品量:一般需要1-10 mL样品(或相当于样品的重量)。对于某些特定的生物样品,如脑脊液,需要较小的样品量。

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    样品要求根据不同的技术和分析平台略有不同,一般来说,样品应该保持新鲜、无污染、保存在恰当的条件下。样品应该尽可能少的被处理,避免在样品制备过程中对代谢物的影响。建议使用新鲜组织或血液、尿液等样品,样品数量应该足够进行多次实验重复。具体样本类型的取样方法,请联系天昊技术人员详询。

    注意事项 :

    样品无论何种类型都禁止含有下列物质,一旦发现,将立即终止实验,由此造成的损失由客户自己承担:

    a) 三乙胺:强烈的正谱抑制现象,极难清除。

    b) 三氟乙酸:强烈的负谱抑制现象,极难清除。

    c) 四氢呋喃:腐蚀溶胀管路密封圈,易燃易爆。

    d) 强酸强碱:包括硫酸、盐酸、磷酸、高氯酸、磺酸、氢氧化钠等。

    e) 非挥发/金属盐:包括各类磷酸/碳酸盐缓冲液、生理盐水、胶体金等(用于清洗细胞组织的缓冲液等,需离心后尽量倒掉)。

    f) 采血管只接收红盖(无添加),紫盖(添加EDTA),绿盖(添加肝素钠)。禁用PAXgene 管,添加促凝剂的红盖管等。




  • 非靶向代谢组学检测的分析流程主要包括以下几个步骤:

    (1)样品制备:将样品进行处理、提取、净化等步骤,以获得代谢产物的混合物。

    (2)液相色谱分离:采用液相色谱技术对代谢产物进行分离和纯化。

    (3)质谱分析:采用质谱技术对分离得到的代谢产物进行鉴定和定量。

    (4)数据分析:利用生物信息学方法对质谱数据进行处理和分析,以识别代谢物,并进行定量和差异分析等。

    非靶向代谢组学检测的结果主要包括代谢物的定量和鉴定信息。通常,鉴定出的代谢物会与数据库中的代谢物进行比对,以确定代谢物的化学结构和生物功能。此外,还可以进行差异分析、通路分析等,以了解代谢物在不同条件下的变化情况,以及代谢通路的调控机制等。

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  • 1、Li N, Wang J, Liu P, Li J, Xu C. Multi-omics reveals that Bifidobacterium breve M-16V may alleviate the immune dysregulation caused by nanopolystyrene. Environ Int. 2022 May;163:107191. doi: 10.1016/j.envint.2022.107191. Epub 2022 Mar 21. PMID: 35325770.

    2、Meng Q, Ma M, Zhang W, Bi Y, Cheng P, Yu X, Fu Y, Chao Y, Ji T, Li J, Chen Q, Zhang Q, Li Y, Shan J, Bian H. The gut microbiota during the progression of atherosclerosis in the perimenopausal period shows specific compositional changes and significant correlations with circulating lipid metabolites. Gut Microbes. 2021 Jan-Dec;13(1):1-27. doi: 10.1080/19490976.2021.1880220. PMID: 33691599; PMCID: PMC7954427.

    3、Zhang J, Feng D, Law HK, Wu Y, Zhu GH, Huang WY, Kang Y. Integrative Analysis of Gut Microbiota and Fecal Metabolites in Rats after Prednisone Treatment. Microbiol Spectr. 2021 Dec 22;9(3):e0065021. doi: 10.1128/Spectrum.00650-21. Epub 2021 Nov 10. PMID: 34756061; PMCID: PMC8579919.

    4、Feng P, Yang J, Zhao S, Ling Z, Han R, Wu Y, Salama ES, Kakade A, Khan A, Jin W, Zhang W, Jeon BH, Fan J, Liu M, Mamtimin T, Liu P, Li X. Human supplementation with Pediococcus acidilactici GR-1 decreases heavy metals levels through modifying the gut microbiota and metabolome. NPJ Biofilms Microbiomes. 2022 Aug 16;8(1):63. doi: 10.1038/s41522-022-00326-8. PMID: 35974020; PMCID: PMC9381558.




  • 1、非靶向代谢组学检测可以用来研究哪些问题?

    答:非靶向代谢组学检测可以用来研究很多生物医学领域的问题,如药物研发、疾病诊断、营养与健康等方面。通过分析生物样品中的代谢物组成,可以揭示不同生理状态下的代谢通路、代谢产物等信息,从而深入了解生物体内的代谢过程。


    2、非靶向代谢组学检测和靶向代谢物分析有什么区别?

    答:非靶向代谢组学检测和靶向代谢物分析的区别在于,前者是一种全面分析生物体内代谢物组成的方法,不需要预先选择特定代谢物进行分析;而后者则是针对特定代谢物的检测和定量。虽然靶向代谢物分析可以更精准地定量和检测特定代谢物,但非靶向代谢组学检测可以提供更全面和系统的代谢物组成信息,有助于揭示生物体内的代谢通路、代谢产物等信息。


    3、非靶向代谢组学检测的数据分析如何进行?

    答:非靶向代谢组学检测的数据分析包括数据预处理、特征提取、数据降维、统计分析等步骤。数据预处理包括去除噪声、对齐、归一化等步骤,以保证检测结果的可靠性和一致性。特征提取是将复杂的检测结果转化为可解释和可分析的特征矩阵的过程。数据降维则是将高维度的特征矩阵降至低维度,以便进行可视化和统计分析。统计分析则是根据不同的研究问题,选择合适的统计方法进行分析,如主成分分析、偏小二乘判别分析等。




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