许多生物相关研究都使用细胞，但是细胞系污染和错误鉴定一直是一个普遍存在的问题，据报道，国外实验室有20%左右的细胞株被错误判断和交叉污染，ATCC和NIH等机构已经建议对实验所用细胞进行鉴定，以保证实验数据的准确性和可重复性，很多杂志编辑部也要求作者投稿时附上细胞株鉴定证明，很多细胞库现在都要对提交来的细胞系进行鉴定，并对细胞系之间的交叉污染进行监测。生物药注册申报、课题基金申请、高质量文献发表，细胞系鉴定的数据报告必不可少。

STR（Short Tandem Repeat）细胞株鉴定是用于验证和识别细胞株的一种常见方法。它通过分析细胞DNA中特定的短串联重复序列来鉴定细胞株的身份。STR广泛存在于人类及哺乳动物的基因组中，具有高度多态性，它们一般由2-6个碱基构成一个核心序列，核心序列串联重复排列，由核心序列重复数目的变化产生长度多态性。其多态性主要源自核心序列重复次数在个体间的差异，因此利用STR可以有效进行细胞鉴定。大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的有效和准确的方法之一，STR基因分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐。美国的ATCC细胞库，德国的DSMZ细胞库以及日本的JCRB细胞库等为STR分型提供了各种细胞株的数据供比对。

技术优势：

• 高度丰富信息：针对ATCC检测的8个特异性位点以及性别决定位点Amelogenin设计，可以准确判断交叉污染和细胞类型；

• 高灵敏度：可以检测低至0.4ng DNA，微量污染也可检测；

• 高通量系统化平台：日处理量上千个检测，数据分析比对采用自动化软件分析系统，结果更加准确客观。

样品要求：

基因组DNA：

      a) 样品需求量：总量≥400 ng；浓度≥20ng/μl；

      b) 样品纯度：OD260/280=1.8~2.0；

      c) 样品无明显降解。

细胞样本：

      a) 细胞数≥106 cells；

      b) 低温运输保存；

      c) 样品无明显降解。

实验流程：

      a) 获得需鉴定的细胞系；

      b) 样品DNA抽提与质检；

      c) STR位点荧光引物PCR扩增；

      d) 3730XL毛细管电泳仪电泳，得到细胞基因STR位点分型数据；

      e) 将得到的数据分析后与细胞数据库对比。

结果提供：

  a) 项目报告：包括实验过程及涉及的分型胶电泳图与说明，STR分型结果，基因型信息，细胞株鉴定分析分析结果等；

  b) 原始数据及客户所需的其它资料。

结果展示：

3730XL毛细管电泳仪电泳，得到细胞基因STR位点分型数据

将得到的数据分析后与细胞数据库对比

以上细胞为例，100%匹配的共有3例

1. Feedback activation of leukemia inhibitory factor receptor limits response to histone deacetylase inhibitors in breast cancer. Cancer Cell. 2016 Sep 12;30(3):459-73.(IF=23.214 )
2. c-Myc alteration determines the therapeutic response to FGFR inhibitors.Clinical Cancer Research. 2016 Jul 11. (IF=8.738)
3. JX06 selectively inhibits pyruvate dehydrogenase kinase PDK1 by a covalent cysteine modification. Cancer research. 2015 Nov 15;75(22):4923-36. (IF=8.556)
4. The Marine-Derived Oligosaccharide Sulfate MS80, a Novel Transforming Growth Factor b1 Inhibitor, Reverses Epithelial Mesenchymal Transition Induced by Transforming Growth Factor-b1 and Suppresses Tumor Metastasis. Journal of pharmacology and experimental therapeutics. 2016 Oct;359(1):54-61. (IF=3.76)
5. Triptolide Induces Cell Killing in Multidrug-Resistant Tumor Cells via CDK7/RPB1 Rather than XPB or p44. Molecular cancer therapeutics. 2016 Jul;15(7):1495-503. (IF=5.58)

1、污染问题：细胞株之间的污染可能导致STR分析结果不准确。解决方法包括确保细胞的分离和培养条件严格控制，以防止污染。

2、细胞株不稳定：细胞在培养中可能发生遗传变异，导致STR分析结果与原始细胞株不匹配。为了解决这个问题，应定期重新鉴定细胞株并建立冻存备份。

3、数据解释问题：STR分析产生的数据需要进行解释和比对，可能需要与已知数据库中的STR数据进行比对，以确定细胞株的身份。解释数据时要注意数据处理和分析的标准化，以减少误差。

4、细胞株交叉污染：在实验室中，不小心将不同细胞株的细胞混合在一起可能导致细胞株鉴定错误。为了避免这种问题，需要在操作细胞株时应在管理标准化高的实验室进行检测。