昊为泰生物多年专注于深耕遗传学和基因组学等领域科研特色技术的开发,不断跟进国际先进的科研成果及技术发展,创新研发了许多特色专利技术和领域内前沿的检测服务项目,受到广大专业科研用户的认可和好评。
细菌/真菌广泛存在于大自然中,其具有多样性丰富,基因组较小等特征。其中细菌是一类只存在拟核的裸露DNA的单细胞原核生物(基因组大小一般小于10Mb),它包括细菌和古菌两大类群。真菌则是一种低等真核生物(基因组大小约为2.5 Mb-100Mb),复杂度介于细菌和动植物之间。
随着高通量测序技术的迅速发展,通过细菌、真菌基因组重测序技术,可以获得某个细菌/真菌基因组信息,不但帮助我们了解其表型特征,致病机制以及其重要相关基因的功能,还可以通过和其它细菌/真菌基因组信息进行比对分析和进化分析,从而了解其分子进化机制。
样品类型:溶解于蒸馏水或TE (pH 8.0)中的基因组DNA
样品需求量:Qubit检测,要求浓度≥50ng/μL,总量≥2.5μg
样品纯度:OD 260/280介于1.8-2.0,OD260/230 ≥2.0
样品完整度:琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA完整性,要求电泳条带清晰可见,无明显降解,且无RNA污染
基因组重测序的分析流程包括质量控制、序列拼接、基因组组装、基因注释、基因定位等。基因组重测序的结果包括:
基因组大小:测定基因组的长度、GC含量等。
基因组组装:对原始测序数据进行拼接,得到参考基因组。
基因注释:通过对基因组序列进行功能预测、基因定位等,得到基因组注释信息。
基因比较:比较不同基因组的差异,包括基因数量、结构变异等。
系统发育分析:通过比较物种回答进化过程、起源发育等问题。
1、基因组重测序的测序深度和覆盖度有什么区别?
答:测序深度指的是每个碱基被测序的次数,覆盖度指的是基因组中每个碱基至少被测序的次数。测序深度越高,覆盖度也越高。
2、基因组重测序可以用于哪些应用?
答:基因组重测序可以用于基因组组装、基因组注释、基因表达分析、基因组比较、基因功能预测、系统发育分析等多种应用。
3、细菌和真菌基因组重测序之间有什么区别?
答:细菌和真菌基因组重测序之间主要的区别在于基因组大小、GC含量和基因密度等方面。通常而言,细菌基因组比真菌基因组小,GC含量较低,基因密度较高。
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