功能微生物是在自然界中由于其功能的重要性而受到广泛关注的一类微生物，如硝化细菌、反硝化菌、氨氧化细菌、硫酸盐还原菌和固氮菌等。每种功能微生物在分类学上可能有很大不同，但却具有相类似的基因使其能够发挥同样的功能，因此使这些功能细菌发挥这种特定功能的基因就称为功能基因，如 nxrA、nirS/nirK、amoA、dsrB、nifH、nifH等。功能基因测序，作为一类特殊的微生物扩增测序项目，是根据复杂环境中具有特殊功能的微生物基因序列设计引物，用该引物进行 PCR 扩增，建库后进行高通量测序。功能基因测序可有效研究特定环境中的功能微生物物种信息，包括：功能微生物物种差异、分类和丰度等，并与每个采样点的环境因子相结合，可以同时分析环境因子与功能细菌群落结构的关系，对复杂环境中的微生物构成研究有重要的指导作用。

1. 样本类型：

1) 完整无污染的基因组DNA，样本需求量：10ul（保证2次实验用量）（指至少0.5g样本进行抽提，50-70ul体积溶解的DNA原液）

2) 土壤等原始样本：样本需求量≥2g

功能基因列表

分析内容

1、 Yu Q, Zhou R, Wang Y, Feng T, Li H. Corpse decomposition increases nitrogen pollution and alters the succession of nirK-type denitrifying communities in different water types. Sci Total Environ. 2020 Dec 10;747:141472. doi: 10.1016/j.scitotenv.2020.141472. Epub 2020 Aug 6. PMID: 32795804.

2、 Luo G, Sun B, Li L, et al. Understanding how long-term organic amendments increase soil phosphatase activities: insight into phoD-and phoC-harboring functional microbial populations[J]. Soil Biology and Biochemistry, 2019, 139: 107632.

1、常规微生物功能基因扩增子测序与16S rRNA测序有什么区别？

A: 侧重点不同。常规微生物功能基因扩增子测序是对微生物群落中的某个或几个有重要作用的功能基因进行扩增和测序，可以得到更多各类功能循环相关的信息，如碳循环、氮循环和磷循环等。而16S rRNA测序更侧重于对样本的物种组成及群落多样性等信息进行检测。

2、常规微生物功能基因扩增子测序技术的数据如何解释和分析？

A: 通过对序列进行注释和分类，可以得到微生物群落中物种组成和丰度、功能注释等信息。可以使用各种数据分析软件对数据进行进一步分析和解释。