“昊创新、好技术！”
昊为泰生物多年专注于深耕遗传学和基因组学等领域科研特色技术的开发，不断跟进国际先进的科研成果及技术发展，创新研发了许多特色专利技术和领域内前沿的检测服务项目，受到广大专业科研用户的认可和好评。
5-羟甲基胞嘧啶（5-hydroxymethylcytosine, 5hmC）是甲基化胞嘧啶（5-methylcytosine, 5mC）在TET蛋白酶（ten-eleven translocation, TET）氧化作用下产生的一种表观遗传学修饰。5hmC具有重要的生物学功能，不仅在DNA去甲基化调控过程中起作用，并参与染色体重编程、基因转录与表达等调控过程，且5hmC可能与特定的疾病发生密切相关，或可成为某些疾病早期诊断的分子标志物。因此，发展可靠、准确和灵敏的5hmC检测技术对生物学、转化医学等研究具有重要意义。
全基因组羟甲基化测序方法原理是使用AID/APOBEC家族DNA脱氨酶—APOBEC代替化学脱氨，该酶可特异性地使C及5mC脱氨为U/T，而5hmC经保护不受其脱氨作用而被检测识别。该方法无需亚硫酸氢盐，可在单碱基分辨率条件下进行5hmC的检测定位，起始量低，准确性高，性价比优，是DNA羟甲基化研究的强有力工具。
技术路线：
技术优势：
特异性：可区分甲基化和羟甲基化位点，特异性的检测羟甲基化位点；
低起始量：使用脱氨酶处理基因组DNA，减少基因组DNA损失，所需DNA起始量低；
全面检测：全基因组范围内单碱基水平上对C位点羟甲基化进行检测；
高性价比：仅需一个文库即可进行羟甲基化检测，更加经济、高效。
样本类型：溶解于蒸馏水或TE (pH 8.0)中的基因组DNA
样品需求量：Qubit检测，要求浓度≥50ng/μL，总量≥1μg
样品完整度：琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA完整性，要求电泳条带清晰可见，无明显降解，且无RNA污染
样品运输：DNA低温运输，每个离心管用parafilm膜密封
数据分析内容：
1) 数据质控及序列比对统计 2) 转化效率统计 3) 羟甲基化位点识别及CG、CHG和CHH的分布 4) 羟甲基化水平估算 5) 不同基因结构元件的胞嘧啶羟甲基化程度 6) 羟甲基化区域分析与可视化展示 7) 差异羟甲基化区域分析 8) 差异羟甲基化区域相关基因富集分析及注释 |
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