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技术服务

SNPseq®超高通量SNP分型技术

SNPseq®超高通量SNP分型技术

技术简介:

       适用于针对大通量SNP位点的分型项目,至少1000个以上样本、300至数千个以上的SNP位点;对绝大多数SNP位点都具有很好的分型效果。

SNPseq®是由上海天昊生物科技有限公司自主专利开发的多重SNP分型专利技术。

技术原理:


      SNPseq®是由上海天昊生物科技有限公司自主专利开发的多重SNP分型专利技术。该技术能在一个检测流程中同时实现300至数千个SNP位点进行分型。该技术基本原理是采用多重PCR对包含有待分型SNP位点的DNA区段富集,通过通用引物PCR扩增构建二代测序上样文库,最后通过Illumina® Hiseq高通量测序(500~1000X),结合二代测序数据分析获取各个SNP位点的基因型。

高效快速:

       每个反应可以实现数千个SNP位点分型检测,同时可将上千个样本标记混在一起检测,1台Illumina® Hiseq2500可以在3天之内完成800万个分型 ,而常规芯片只能单个或数个样本同时检测。

操作简单:

       1个连接反应,1个PCR反应,1次纯化即可上机器,而常规芯片分型检测操作繁琐。

成本低廉:

       同目前的SNP定制芯片相比,我们可以自行设计探针体系与试剂,基于二代测序技术分型,单个SNP分型成本很低。

准确性高:

      由于连接酶识别特异性高,且非特异性连接产物可通过测序数据分析排除,大大提高数据准确性。

技术参数:

     • SNP数量:300-数千
     • 样品数量:> 1000个
     • 位点成功率:>95%
     • Call rate:>98%
     • 准确性:>99.8%

检测实例:

测序分型数据:

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