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技术服务

SNPscan®高通量SNP分型技术

SNPscan®高通量SNP分型技术

技术简介:

       适合于针对中等通量到大通量SNP位点的分型项目,至少800个以上样本、48个以上的SNP位点;对绝大多数SNP位点都具有很好的分型效果。

技术方法:


      SNPscan®是由上海天昊生物科技有限公司自主专利开发的多重SNP分型专利技术,能在一个检测流程中同时实现对48/96/144/192个SNP位点进行分型。该技术基本原理是采用连接酶连接反应的高特异性实现对SNP位点等位基因的识别,然后通过在连接探针末段引入不同长度的非特异序列以及通过连接酶加接反应获得位点对应的不同长度连接产物,利用标记荧光的通用引物对连接产物进行PCR扩增,通过荧光毛细管电泳对扩增产物进行电泳分离,最后通过对GeneMapper软件分析获取各个SNP位点的基因型。

应用领域:


      本方法可涉及到多个需要SNP分型的遗传研究领域。适合对于大量候选生物通路或者候选染色体区域的基因SNP分型,尤其适合针对全基因组SNP关联研究获得的初步阳性位点,以及全基因组测序得到的大量初筛突变位点进行进一步的大样品验证研究。



 • 高准确性:检测的准确率可达99.9%;
 • 高通量:以拥有1台ABI3730XL为例,一天可以产生11万个分型数据;
 • 低成本:检测成本明显低于其他中高通量SNP分型技术;
 • 高成功率:位点检出率通常达95%以上,每个位点的平均样本检出率可达98%以上;
 • 高效性:以96个位点2000个样本为例,实验检测体系构建、优化、检测需8个周,及数据判读需1个周。
 • 高灵活性:可根据客户需求进行设计合成Customer Design Panel及试剂盒,您只需拥有荧光毛细管电泳仪就可以轻松实现高效快速的SNP多重检测技术。省去繁琐的国外定制流程,更快速、更便宜。

检测对象:

      基因组DNA

服务内容:

     • 课题的设计咨询包括检测位点的选取;
     • DNA样本的质检与标化;
     • SNP分型所用引物的设计、合成与优化;
     • SNPscan分型;
     • 分型数据的分析与结果报告。

检测实例:

48个SNP位点分型截图:

分颜色截图(有Panel):

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