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技术服务

LDR多重SNP分型技术(3-8 plex)

LDR多重SNP分型技术(3-8 plex)

技术简介:

       多个SNP位点(3-8个)的分型项目,样本量可以几百个到上千个。

技术方法:


      连接酶检测反应 (ligase detection reaction,LDR)是利用高温连接酶实现对基因多态性位点的识别。高温连接酶一旦检测到DNA与互补的两条寡聚核苷酸接头对应处存在着基因点突变类型的碱基错配,则连接反应就不能进行。

      如下左图:右边的探针与模板有一个碱基不配对,所以连接反应不能进行,没有连接产物;左边的探针与模板DNA完全互补,故进行连接反应。通过温控循环该特异性连接反应可反复进行,达到线性扩增的效果。当检测到DNA与互补的两条寡聚核昔酸接头对应处存在着碱基错配,则连接反应就不能进行。在同时存在着荧光标记的探针时,由于前者与模板DNA互补,故它与下游探针的连接反应得以进行,而后者则无法与下游探针连接。在连接反应结束后进行测序仪检测,检测到的结果即为G,从而可认定该SNP位点为G。LDR检测方法利用长度差异可以将多重LDR产物在ABI测序系统中进行检测,实现一次检测多个SNP位点。

应用领域:


      本方法适用于多个涉及到SNP分型的遗传研究领域。

检测对象:

      基因组DNA

服务内容:

     • 课题的设计咨询包括检测位点的选取;
     • DNA样本的质检与标化;
     • SNP分型所用引物的设计、合成与优化;
     • LDR SNP分型;
     • 分型数据的分析与结果报告。

检测实例:

     2个样品的7个SNP位点分型图
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