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杂合性缺失

杂合性缺失

技术简介:

    杂合性缺失(loss of heterozygosity, LOH),即一个位点上两个多态性的等位基因中的一个出现缺失,是在肿瘤细胞中一种非常常见的DNA变异。很多癌症的发生发展与一些染色体区带上发生杂合性缺失(LOH)存在明显的相关性,抑癌基因的杂合性缺失会导致肿瘤的发生,利用STR的高度多态性检测这些染色体区带上的杂合性缺失有助于癌症早期发现,癌症复发检测等。

技术方法:

    利用荧光标记的PCR引物对怀疑存在杂合性缺失的区域内多个微卫星多态位点进行扩增,然后采用高分辨率胶电泳(如用于测序的毛细管电泳等)对扩增片断进行分离,通过荧光检测系统(如ABI测序仪)确定扩增片断的长度,实现对微卫星多态位点的分型,同时利用荧光毛细管电泳的精确定量性能可以较好的检测杂合性缺失。如果某个位点是杂合子,可以根据比较癌旁组织和癌组织的两个等位基因的峰高比来检测是否存在缺失以及缺失的比例。也可以计算杂合性缺失的具体比例,实验过程也相对方便和快捷。另外,我们还可以在计算缺失比例时进行修正,去除STR位点存在滑移现象的影响,使结果更加准确。

应用领域:

    该技术广泛的运用于肿瘤基因组学的研究。


检测对象:

    癌旁组织和癌组织的样本基因组DNA

服务内容:

  • 候选区域的STR位点的设计、合成和优化。
  • STR分型实验。
  • STR分型结果判读。
  • 癌和癌旁组织的比较发现LOH存在和区域。


检测实例:

不发生和发生杂合性缺失的荧光毛细管电泳图(上为癌旁组织,下为癌组织):


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