咨询热线:400-065-6886   天昊基因

中文 / English

主页 > 技术服务 > 目的区域富集甲基化测序

MethylTarget®多重目的区域甲基化富集测序技术

MethylTarget®多重目的区域甲基化富集测序技术

技术简介:

      甲基化是一种非常重要的表观遗传学标记信息,参与了包括基因调控、生物发育、疾病等方方面面,并且在大多数癌症中广泛发现甲基化异常。除了对于全基因组甲基化水平的观察与研究,对于众多目的候选基因的甲基化水平研究则更有针对性和大样本可行性。使用亚硫酸盐将DNA进行修饰后,天昊生物结合目的区域富集和二代测序技术,推出自主研发的MethylTarget®多重目的区域甲基化富集测序技术,在大幅度降低研究费用的同时实现个性化目的区域测序检测(targeted bisulfite sequencing)。

基本原理:


技术优势:


     • 基于二代测序,可以获得目标区域内所有C的甲基化数据。
     • ~1000×的测序深度,精确计算每个位点C的甲基化程度。
     • 通量高,可同时对成百上千个区域进行甲基化程度分析。
     • 适用于大样本多区域的DNA甲基化水平检测。

技术参数与实验流程


技术参数


样本要求 测序策略 数据要求
  • 样品类型:完整无污染的基因组DNA;
  • 样本浓度:浓度 ≥ 50ng/μL;
  • 样本纯度:OD 260/280介于1.8-2.0,OD260/230 ≥2.0;
  • 样品需求量:总量>1µg (满足70个目的片段测序);
Hiseq 2×150,1000×;
  • 所有样本目标区域测序深度平均>1000×,Q30>80%
  • 90%样本测序深度>500×
  • 平均测序深度>500×的样本,90%以上的测序片段测序深度大10×

实验流程

建库测序流程



数据分析流程



参考文献

上海天昊生物科技有限公司 版权所有 沪ICP备17008908号
地址:上海市浦东新区康桥路787号9号楼 邮箱:techsupport@geneskies.com 电话:400-065-6886