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【昊文章】天昊客户细菌+真菌扩增子测序文章见刊《Frontiers in Microbiology》


原创 上海天昊生物 
 

“昊”文章

影响因子:4.239

期刊名:Frontiers in Microbiology

天昊生物提供的技术服务:
微生物细菌16S和真菌ITS1扩增子相对定量测序

 

在刚刚结束的5月份,国际微生物专业性学术期刊《Frontiers in Microbiology》发表了淮北师范大学刘远课题组、中国科学院新疆生态与地理研究所姜黎课题组及南京农业大学合作发表的最新研究成果。该研究利用三年时间,系统分析了生物炭的施用对碱性大豆土壤中的细菌和真菌群落的影响。在本项研究中,天昊生物有幸承担了微生物细菌16S和真菌ITS1扩增子相对定量测序工作

 
英文题目:Different Responses of Soil Bacterial and Fungal Communities to 3 Years of Biochar Amendment in an Alkaline Soybean Soil
中文题目:连续三年施用生物炭对碱性大豆土壤中细菌和真菌群落的影响
期刊名: Frontiers in Microbiology
发表时间:2021526
影响因子:4.239
 

 

研究概要

 

生物炭作为土壤改良剂被认为是一种很有前途的提高土壤肥力的方法。然而,生物炭和生物炭复合肥施用后微生物群落的响应尚未完全阐明。这项研究使用细菌16SV4-V5)和真菌ITS1扩增子相对定量及qPCR定量方法来评估细菌和真菌群落的丰度和组成的变化。
 
在本研究中,田间试验历时三年,共分5个处理:化肥作对照(CK)、秸秆还田与化肥配施(CS)、生物炭缓释与化肥配施(LB)、高生物炭与化肥配施(HB)和生物有机肥配施(BCF)
 
结果表明,生物炭的添加不会改变大田土壤和根际土壤中细菌的数量和多样性。然而,生物炭的添加显著增加了土壤中真菌的数量(图1)。


图片
 

1、大豆大田土壤和根际土壤中细菌16S rRNA (A)和真菌 ITS1 (B)基因拷贝的丰度。

 

在样品中发现的细菌优势菌门是变形菌门(Proteobacteria)、放线菌(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)。施加生物炭增加了大田土壤和根际土壤中放线菌门的相对丰度。真菌优势菌门为子囊菌门(Ascomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)和担子菌门(Basidiomycota)。在LBHB中,子囊菌门相对丰度显著降低,而被孢霉门显著增加(图2)。


图片
 

2、大豆大田土壤和根际土壤中细菌和真菌优势菌门的相对丰度。

 

此外,研究者还进行了冗余分析,结果表明细菌和真菌群落的变化与土壤性质有关,如土壤有机碳和总氮,它们是调节群落组成的重要因素。本研究有望为生物炭在农业生态系统中的应用提供重要的理论和实践基础。
 
该论文淮北师范大学硕士研究生高文慧为第一作者,淮北师范大学刘远老师和中国科学院新疆生态与地理研究所姜黎老师为共同通讯作者。研究得到了安徽省高校自然科学研究重大专项、中国科学院新疆生态与地理研究所沙漠与绿洲生态国家重点实验室开放基金及安徽省自然科学基金等项目联合资助。
 
 
 
 

 

PS天昊生物专利新技术Accu16STM细菌绝对定量测序和AccuITSTM真菌绝对定量测序重磅来袭,让细菌+真菌扩增子测序检测数据更加全面、更加真实!

 

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