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天昊扩增子绝对定量测序全面升级,强势助力微生态定量研究


        上一篇我们已经浅谈了微生物绝对定量VS相对定量的优越性,其中多篇文献已经证明只有绝对定量分析才能反映样本每种微生物的真实数量和组间样本的真实差异,因此绝对定量才是进行微生态研究的首选。我司于去年下半年推出微生物16S扩增子绝对定量测序技术以来,受到医学肠道和环境微生物领域老师同学们的广泛欢迎和好评。经过我司研究人员的不懈努力,微生物16S扩增子绝对定量测序成功实现“跨越式”升级!

全新分析流程

      一套测序数据同时进行绝对定量分析和相对定量分析,用接近常规扩增子测序的价格同时得到两套数据,性价比超高!

 


全新分析内容

        结题报告提供的绝对定量和相对定量分析结果都同时覆盖OTU分类分析、群落组成分析、Alpha多样性分析、Beta多样性分析等常规分析板块,得到的两套结果相互对比,相互补充,从而打破常规扩增子测序技术文章套路,建立文章思路新标准!
 
 
 
 
Demo数据证明绝对定量必要性

        购买标准混合菌株DNA(其中不同菌的比例是固定的),并将其标化至10ng/ul:(1)向标准混合菌株DNA(微生物DNA占比100%)中添加外标序列,样本编号为1-1、1-2与1-3;(2)将标准混合菌株DNA与hela细胞基因组DNA按照质量比1:9的比例混合,混合后DNA标化至10ng/ul(微生物DNA占比10%),然后向其中添加外标序列,样本编号为2-1、2-2与2-3;(3)将标准混合菌株DNA与hela细胞基因组DNA按照质量比0.1:9.9的比例混合,混合后DNA标化至10ng/ul(其中微生物DNA占比1%),然后向其中添加外标序列,样本编号为3-1、3-2与3-3。不同组别吸取同样体积,然后用天昊微生物16S扩增子绝对定量测序技术对上述3组样品菌群结构进行检测,不同样本总测序量相当。

        结果发现当不同组别样本微生物总量(微生物总量比值为100:10:1)存在现实差异时,相对定量分析和绝对定量分析得到截然不同的分析结果。(1)相对定量分析得到的结论是:不同组别样本的菌群没有显著差异,即不同组别样本特定菌属的相对丰度(相对比例)相似。(2)而绝对定量分析得到的结论是:与理论预测值相符,不但不同组别样本微生物总量(总拷贝数)差异巨大,并且同一菌属在不同组别的绝对丰度(绝对拷贝数)差异也十分巨大。

        这个Demo数据结果说明如果样本间微生物总量本身存在差异,使用传统相对定量分析会造成错误的研究结论,所以,为了得到样本间细菌群落的真实变化结果,微生态的研究必须用绝对定量分析替代传统的相对定量分析。


       以上就是天昊16S扩增子绝对定量测序部分更新内容和亮点,当然我们也会继续升级有应用价值的分析内容,感兴趣的小伙伴们可以关注天昊生物微信公众号,小编会不定期更新哦。




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